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泛素化结果图(4)-E3泛素连接酶泛素化底物蛋白

2023-07-01 11:15:08 来源:个人图书馆-读博可以毕业哒


(资料图)

泛素化结果图系列文档

泛素化结果图(1) -底物蛋白的降解

泛素化结果图(2)-E3泛素连接酶和底物蛋白的相互作用

泛素化结果图(3)-E3泛素连接酶和底物蛋白不同结构域的相互作用底物蛋白能被泛素化

一般使用外源表达的泛素分子检测蛋白质的泛素化,也可使用內源的泛素抗体。因为泛素化为泛素分子与底物蛋白质的共价结合,SDS无法破坏此种相互作用力,所以图20中能够看到多聚泛素化链的存在。一个泛素分子大约为8.5KD,因此IB结果可能会出现基于底物蛋白质清晰的ladder带或smear带。

图20 过表达相应的蛋白24-48小时后裂解细胞,用Flag抗体IP底物蛋白,用相应抗体IB检测相应蛋白质

底物蛋白能被K48链泛素化

蛋白质泛素化为一种蛋白质翻译后修饰,能够调控蛋白质的功能。目前的泛素化种类有K6,K11,K27,K29,K33,K48,K63,即泛素分子的K6,K11,K27,K29,K33,K48,K63与底物蛋白质共价结合。一般认为,K48的泛素化可被蛋白酶体识别。因此,需要确认底物蛋白质的泛素链为K48链。将泛素分子赖氨酸单位点突变(见图21)或泛素分子单赖氨酸保留突变(见图23),通过免疫沉淀和免疫印迹的方法检测底物蛋白质泛素化的种类,见图22和图24。

图21 泛素分子赖氨酸单位点突变示意图
图22 外源表达泛素分子突变型和野生型,使用Flag抗体IP底物蛋白质,用相应抗体IB检测相应蛋白质
图23 泛素分子单赖氨酸保留突变示意图
图24 外源表达泛素分子突变型和野生型,使用Flag抗体IP底物蛋白质,用相应抗体IB检测相应蛋白质

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